在犬貓中，引起球蟲症最常見的病原為Isospora屬．其中感染狗的有: Isospora canis, Isospora ohioensis, Isospora burrowsi及Isospora neorivolta; 而感染貓咪的則有: Isospora felis及Isospora rivolta．臨床症狀可見下痢、無食慾、發燒、體重減輕、瘦弱、甚至死亡等．
球蟲感染症廣佈於世界各地，多數在營養不良、環境衛生不佳、過份擁擠的飼養環境以及離乳、運輸、飲食突然改變及天氣變化等緊迫的動物容易受影響，而引發臨床症狀．一般對多數牧場動物而言，球蟲症是屬於高感染率、低致病率(5-10%)的疾病．年紀較大的動物較不容易致病，但可能成為帶原者，臨床上健康且成熟的動物可能成為年輕動物感染的來源．
因為球蟲會破壞小腸的上皮細胞以及黏膜層的結締組織細胞，所以會造成出血性腸炎、卡他性腸炎(catarrhal inflammation)及下痢等．嚴重狀況下可能造成脫水、進而死亡．
診斷上以浮遊法搭配顯微鏡做糞便檢查，檢出球蟲卵囊以便確診．但因為下痢往往會在排出卵囊前幾天就發生，並且持續至卵囊排出減少後，所以若只單獨檢驗一次糞便，可能會造成誤判．建議於同一隻動物多採幾次不同糞便，或採集同一窩動物不同的糞便做檢驗，以利確定診斷．
要如何預防球蟲症的發生呢？
基本上，避免球蟲感染的方式就是避免吃入球蟲卵囊的機會．因此，預防的重點著重在增加個體免疫力、減少緊迫以及環境的衛生等，如下所列：
- 良好及平衡的營養
- 衛生的環境
- 正確的飼養管理
- 初生動物要接受初乳
- 減少緊迫的產生(離乳、突然更換食物以及運輸等)